ประเทศไทยมีพืชน้ำมันที่สามารถใช้ผลิตไบโอดีเซลได้หลากหลายมากมาย ปาล์มน้ำมันและสบู่ดำเป็นพืชน้ำมันตัวเด่นในเรื่องนี้ แต่ก็มีพืชอื่นๆ ด้วย เช่น

ถั่วลิสง

เมล็ดมีน้ำมัน 50-60% แต่เนื่องจากพื้นที่เพาะปลูก ลดลงอย่างต่อเนื่อง ปริมาณที่ผลิตได้จึงไม่เพียงพอกับความต้องการใช้ภายในประเทศ

งา

ผลผลิตจำนวน 65% ส่งออกไปยังต่างประเทศ น้ำมันงามีคุณค่าทางโภชนาการสูง เหมาะแก่การนำไปปรุงอาหารมากกว่าที่จะใช้ผลิตไบโอดีเซล

ทานตะวัน

เป็นพืชที่ปลูกเพื่อใช้เมล็ดในการบริโภค ตลาดมี ความต้องการสูง ขณะที่ปริมาณการเพาะปลูกไม่ได้เพิ่มขึ้น จึงไม่เหมาะที่จะนำมาผลิตไบโอดีเซล

ละหุ่ง

เป็นพืชที่ตลาดโลกมีความต้องการใช้งานสูง โดยนำไปใช้ในอุตสาหกรรมต่างๆ อาทิ อุตสาหกรรมยา จึงทำให้มีปริมาณไม่เพียงพอ และไม่ได้นำไปใช้ผลิตไบโอดีเซลมากนัก

ถั่วเหลือง

เป็นพืชน้ำมันที่ใช้กันอย่างกว้างขวาง ในขณะที่ผลผลิตของไทยมีปริมาณลดลงทุกปี จึงไม่เพียงพอต่อความต้องการ และไม่มีศักยภาพพอที่จะเป็นวัตถุดิบในการผลิตไบโอดีเซลในไทย

มะพร้าว

เป็นพืชน้ำมันที่สำคัญ ปลูกได้ ในทุกภาคของประเทศ โดยไทยสามารถผลิตมากเป็นอันดับ 5 ของโลก และมีการขยายตัวทุกปี แต่ผลผลิตของมะพร้าวมักนำมาทำเนื้อมะพร้าวแห้งจำหน่าย หากจะนำมาเป็นวัตถุดิบในการผลิตไบโอดีเซล รัฐต้องเร่งส่งเสริมให้เกตรกรปลูกมะพร้าวมากขึ้น